司馬懿(吳秀波 飾)自斷雙腿避仕官渡之戰即將打響

曹丕(李晨 飾)委婉表達自己想讓司馬懿輔佐自己。然而司馬懿雖有志向致仕，但并非為曹氏一族效力，因此司馬懿婉拒曹丕，裝作聽不懂曹丕話中含義。曹丕半勸半威脅，如若是曹操(于和偉 飾)在這里，絕不會對司馬懿這么客氣，也早就沒機會顧左右而言他;納賢不成，曹丕拂袖而去。

曹操命人將楊修(翟天臨 飾)帶到面前審問，楊修以自己身為袁紹外甥為條件，懇請曹操開恩讓自己將功折罪。曹操同意釋放楊修，并使用苦肉計打了楊修五十大板，命他假意前往袁紹處投奔，里應外合鏟除袁紹。

曹丕回府看見楊修被曹操釋放，不明其中緣由便詢問;曹操答楊修此人才智絕倫，在這亂世中是難得的人才，且控制了楊修便可控制楊彪，進而可以控制那些心懷異志的大臣，將楊彪孤立。就如當初起用荀彧(王勁松 飾)那樣，不僅僅因為他的謀略，更因為荀彧背后乃是整個潁川的氏族;這些氏族互相聯姻，榮辱與共，控制住了荀彧就等于擁有了整個氏族。

曹丕建議曹操將司馬懿也起用，借司馬懿來控制楊修，一面可以控制司馬防，一面可以防止楊修獨大，日后失去控制。然曹操聽后，只是不語大笑，嚇得曹丕連忙站了起來。

第二日，冊封司馬懿為主簿的旨意立刻到達司馬府，司馬懿心中五味雜陳，被曹操招為主簿必然不會是好事。因此，司馬懿走進馬廄將所有裝滿重物的麻袋扛進馬車，自己躺在馬車轱轆下驅動馬車，令轱轆壓斷雙腳。

曹丕得知司馬懿的雙腳被壓斷，氣得闖入司馬懿房中掀開被子要查看。為了讓曹丕相信自己的腳真的是意外壓斷，司馬懿命侯吉(來喜 飾)拆解腳上綁帶給曹丕看，曹丕氣得大喝司馬懿其心可誅，怒而離去。

當曹操等人知道司馬懿雙腳被壓斷的消息，并沒有多大意外，而是在朝中散布司馬懿暗通袁紹，自行壓斷雙腳就是為了躲避致仕曹操，轉而投奔袁紹。司馬朗將消息帶給司馬懿，向來聰敏的司馬懿一下便猜出曹操是在迫自己出面澄清。

大軍師司馬懿之軍師聯盟劇照

逼不得已之下，張春華(劉濤 飾)將司馬懿抬到司空府前請罪，楊修奉命攜太醫慰問司馬懿，楊修挑選了最粗的銀針扎向司馬懿的斷腿。任憑銀針怎么使力，司馬懿面相一點兒變化也沒有，曹操叫來司馬朗，刻意言明命他回家好好照顧司馬懿。

一波未平一波又起，時值建安五年，袁紹兵逼官渡，曹操率軍前往官渡應戰，展開了中原霸主的最后之戰，史稱官渡之戰。曹操行軍前將許都事務交托給郭嘉(曹磊 飾)和荀彧，并詢問自己的兒子中誰可以擔當大任，曹操給了兩人竹排和毛筆各自寫下名字。等荀彧、郭嘉寫完上交，曹操看過竹排后欣然大笑。

曹操大軍行至野外，遇見蔡邕所著的曹娥碑，眾人上前議論猜測曹娥碑上所寫的八個字詞為何意。機制聰敏的楊修率先猜出，正欲告訴曹操，曹操阻止了楊修，欲自行猜測。

曹操出軍離開許都后，司馬府中熱鬧一片，侯吉下廚做了可口飯菜五味脯給司馬懿品嘗，司馬懿自從斷腿后寸步難行，故做了輪椅代步，方便自己行動。司馬孚(王東 飾)告知司馬懿曹操出軍官渡，親自討伐袁紹，司馬懿拿出許都與官渡的地圖翻看，